El órgano de Gobierno de la Fundación Conama es su patronato.
Conforme a la Ley 50/2002, de 26 de diciembre, de Fundaciones, corresponde al Patronato cumplir los fines fundacionales y administrar con diligencia los bienes y derechos que integran el patrimonio de la fundación, manteniendo el rendimiento y utilidad de estos. El patronato está formado por los siguientes patronos independientes:

El equipo de Conama lo forman en realidad cientos de personas sin cuyo esfuerzo no sería posible la actividad de la Fundación en sus muy diversos frentes. Son cientos, efectivamente, los expertos, los investigadores, los responsables políticos, los profesionales y otros tantos colaboradores que con su dedicación hacen posible todas y cada una de las actividades. Aquí presentamos a los que tienen como misión permanente coordinar y hacer posible el trabajo de esta gran comunidad de conocimiento en torno a la sostenibilidad